福建深沪湾海底古森林遗迹自然保护区位于台湾海峡西岸中段，著名的平潭——南澳变质带中部，福建晋江半岛东南端的深沪湾内，以保护7500年前的古树桩遗迹、9000-25000年前的已胶结古牡蛎礁、石圳海岸变质岩区、老红砂分布区和海岸沙丘等地质景观为主要内容，全区面积 27km2。自1986年发现以来，先后于1990年6月被定为县级保护区，1992年被国务院以国函92 （166）号文确立为国家级海洋自然保护区。

　　深沪湾自然保护区所发现的海底古森林遗迹主要分布于距海岸100m～200m外，通常水深约 2～3m的潮间带，呈三片分布，已发现有60余棵以上。原始直立状态保存良好。据中国科学院华南植物研究所、华南农业大学和福建师范大学地理所等多家单位鉴定，这些海底古森林遗迹以裸子植物油杉为主，夹有皂荚树、桑树、南亚松等多个属种。据多个品种 14C同位素年龄测定，其年龄在距今6761±193年至距今7620±130年之间。

　　古牡蛎礁，主要分布于中潮区，礁体长约500m、宽约300m、厚约20～40cm。从壳体分析，主要以长牡蛎、僧帽牡蛎和近江牡蛎为主，直接附着于基岩上，呈原生直立双瓣俱存完整保存下来。根据广州地理所、国家海洋三所、中科院考古研究所和北京大学考古系测得的 14C年龄为距今9355年-25800年之间，且大部分样品测得在距今20000-15000年范围内，因此，深沪湾大片古牡蛎生长年代可追溯至25000年-9000年前及晚更新世的最末盛冰期。

　　石圳海岸变质岩地貌：石川变质岩区是著名的平潭一南澳变质带的一部份。本区由于地处适宜的地理位置，有利的地貌部位，因此能够比较完整地保存并清楚展示其历经早古生代、中生代、新生代等漫长的地质历史演变过程和所经历的复杂的动力、热力变质作用，使之成为研究该构造带出露最为良好的地点。此外变质岩区由于受海浪、风沙长期作用，形成的诸如浪蚀穴、风蚀壁龛、风动石、象形石等丰富多彩的海岸地貌现象，具有重大的科研价值，也是难得的科普教育基地。