本区地处罗霄山脉中段，区内山体峻拔雄伟，层峦叠嶂，串珠状小盆地点缀山间，最高峰井冈山主峰海拔1586米，最低谷湘洲河谷海拔仅230米，相对高差达1300余米。由于历史上因山高路险、人口稀少以及与外界联系甚少，而保存了完整的常绿阔叶林，尤以河西城主峰为核心的大面积原始常绿阔叶林是我国最典型的、完整的中亚热带森林植被。区内植被类型复杂多样，生物资源丰富，并具典型性、代表性、特有性等特征，森林植被有12个植被型，92个群系；维管束植物有3400余种，占江西省植物种数的70％；森林脊椎动物有260多种（鱼类除外），昆虫3000余种，均优于同纬度的其它区域。本区珍稀濒危物种种类较多，列为国家重点保护的野生动物有云豹、黄腹角雉、白颈长尾雉、穿山甲、大鲵等30余种，列为国家重点保护的野生植物有南方红豆杉、福建柏、白豆杉、闽楠、伯乐树等，井冈山特有植物有22种，为我国东亚热带地区重要的生物基因库之一。