根据《财政部关于发布2004年全国政府性基金项目目录的通知》（财综[2004]102号），涉及林业的政府性基金有2项：
（1）育林基金
1、现行育林基金政策
国有林区森工企业育林基金。东北、内蒙古国有林区森工企业，执行林业部、财政部《关于东北、内蒙古国有林区统配木材调价增收的处理和林价（育林基金）的计提等财务问题的通知》（林财字[1991]74号）的规定，按木材销售收入26%提取林价（育林基金），对实行林价制度的东北、内蒙古森工企业按立木提取的林价亦不得低于按木材销售收入的26%提取的水平；其他国有林区森工企业按照财政部、林业部《关于国有林区森林工业企业财务改革若干问题的通知》[（87）财农字第002号]和《关于国有林区森林工业企业财务改革若干问题的补充规定》[（87）财农字第252号]文件规定，按木竹销售收入的21％提取育林基金，按该比例执行有困难的，可适当降低，但不得低于15％，现行提取高于21%的可保留，具体比例由省、自治区人民政府确定。同时规定，育林基金是营林生产资金，其提取和使用均应纳入森工主管部门和企业的财务计划及会计核算统一管理。对企业提取的育林基金原则上60%留给企业，40%上缴省级森工主管部门，用于企业之间调剂。
南方集体林区的育林基金和更新改造资金（即维简费），执行林业部、财政部《关于南方集体林区木材开放后有关育林基金、更改资金征收、使用和管理问题的通知》（林财[1986]20号）及国家经委、林业部、财政部、国家物价局、国家工商行政管理局《关于整顿和调整南方集体林区木材费用负担问题的通知》（经重[1988]122号文件规定，对产区木竹经营单位按其收购后的第一次销售价的20％计征（育林基金为12％，维简费为8％），个别省、自治区执行有困难的，可以适当降低提取标准，但不得低于销售收入的15％。同时规定，育林基金和维简费的绝大部分留给产材县，省、地林业主管部门应适当集中一部分，用于调剂余缺，集中的比例由省、自治区林业部门商同级财政部门确定，并报各省、自治区人民政府批准。
2、关于育林基金改革
育林基金制度始建于建国初期。长期以来，为了培育和发展森林资源，在财政极为困难的情况下，国家提出了以林养林的政策，对恢复我国森林植被，改善生态环境起到了重要的作用。但是，随着社会主义市场经济的发展，公共财政支出框架的建立，国家对林业的投入已发生了根本性的转变，现行育林基金的征收、使用和管理已不适应林业发展的需要。
为了适应深化林业体制改革的要求，进一步规范和加强育林基金管理，根据《中华人民共和国森林法》和《中共中央 国务院关于加快林业发展的决定》，2003年12月，财政部办公厅和国家林业局办公室联合下发了“关于征求对《育林基金管理办法（征求意见稿）》意见的函”，大部分省区已经反馈了建议和意见。今年，在与财政部综合司进一步沟通和协商的基础上，选择部分省区进行专题调研，听取基层财政部门、林业主管部门以及林业生产经营者的意见，力争今年年内由财政部和我局联合下发。
（2）森林植被恢复费
根据财政部、国家林业局关于印发《森林植被恢复费征收使用管理暂行办法》的通知（财综[2002]73号）规定，凡勘查、开采矿藏和修建道路、水利、电力、通讯等各项建设工程需要占用、征用或者临时使用林地，经县级以上人民政府林业主管部门审核同意或者批准的，用地单位应当按照本办法规定向县级以上林业主管部门预缴森林植被恢复费。具体征收标准在办法中已经明确。
