鬼伞类杂菌 这是生活习性与草菇相似的腐生菌,常见的有毛头鬼伞、墨汁鬼伞等。当菇菌上出现这些杂菌时,表明草菇即将长出。但它们的生长会消耗培养料的养分,因此要及时摘除。做好菇场消毒工作和用4%的石灰水浸泡稻草是预防鬼伞类杂菌的常用方法。
小菌核 菌丝比草菇菌丝粗壮,色泽洁白,有丝状光泽。小菌核与草菇争夺养料,并且分泌毒素,危害严重时甚至不出菇。局部污染时,用生石灰粉处理。
疣孢霉 菌丝体呈现白色,棉毛状,能使子实体腐烂,流出黄色分泌物,也可引起草菇畸形,严重时导致草菇停止生长。疣孢霉可以通过蘑菇传染给草菇,因此,要严禁用蘑菇废床料种草菇。如局部受污染的,用20%甲醛消毒。